A integração entre sequenciamento genômico, microbiologia clínica e vigilância epidemiológica está redefinindo o monitoramento da resistência antimicrobiana na Europa. Um amplo levantamento coordenado pelo Centro Europeu de Prevenção e Controle de Doenças (ECDC) identificou a persistência e a expansão de linhagens bacterianas altamente resistentes em hospitais de 36 países, reforçando o papel estratégico da genômica na contenção de infecções associadas à assistência à saúde.
Segundo os resultados publicados no periódico The Lancet Microbe, o cenário atual indica circulação sustentada de Enterobacterales resistentes a carbapenêmicos e, em alguns casos, à colistina, dois dos principais recursos terapêuticos utilizados contra infecções bacterianas graves.
Sequenciamento genômico ganha espaço na vigilância hospitalar
O estudo faz parte do programa CCRE, sigla para Carbapenem- and/or Colistin-Resistant Enterobacterales Survey, iniciativa coordenada pelo ECDC em parceria com a Agência de Saúde Pública da Suécia e o Centre for Genomic Pathogen Surveillance, vinculado à Universidade de Oxford.
A investigação reuniu dados epidemiológicos, microbiológicos e análises de sequenciamento genômico completo obtidos em mais de 300 hospitais europeus. O levantamento utilizou amostras coletadas em 2019 e representa uma evolução importante em relação ao projeto EuSCAPE, conduzido entre 2013 e 2014, que já havia documentado a disseminação de enterobactérias produtoras de carbapenemases no continente europeu.
Além da geração de dados, o programa incluiu treinamento técnico, avaliação de capacidade laboratorial e exercícios de controle externo da qualidade, ampliando a incorporação de metodologias genômicas nos laboratórios nacionais de referência europeus.
Klebsiella pneumoniae mantém circulação de linhagens críticas
Entre os achados considerados mais relevantes está a permanência de linhagens de alto risco de Klebsiella pneumoniaeresistentes a carbapenêmicos em diferentes sistemas hospitalares europeus. Os pesquisadores observaram que clones já identificados na década anterior continuam disseminados, agora associados a maior aquisição de genes de carbapenemase e ao surgimento de variantes com fatores adicionais de virulência.
O estudo também aponta expansão de linhagens multirresistentes emergentes, incluindo isolados com potencial hipervirulento, combinação considerada particularmente preocupante no contexto hospitalar. Em microbiologia clínica, a convergência entre resistência e virulência representa um dos principais desafios atuais para prevenção e controle de infecções.
Dados anteriores já haviam demonstrado que hospitais exercem papel central na disseminação dessas bactérias resistentes. Pesquisadores do Wellcome Sanger Institute observaram, em análise genômica anterior, elevada similaridade genética entre isolados provenientes do mesmo hospital, sugerindo transmissão predominantemente intra-hospitalar.
Escherichia coli resistente acende sinal de alerta
Os resultados relacionados à Escherichia coli também chamaram atenção dos pesquisadores. O levantamento identificou aumento na aquisição de genes de carbapenemase por linhagens de alto risco e expansão clonal de variantes multirresistentes bem adaptadas ao ambiente hospitalar.
Entre os principais marcadores observados está a maior detecção do gene NDM-5, associado à resistência a carbapenêmicos. Segundo os autores, os dados sugerem risco elevado de endemicidade de E. coli resistente a carbapenêmicos em diferentes regiões da Europa caso medidas adicionais de saúde pública não sejam implementadas.
O panorama epidemiológico descrito pelo estudo é heterogêneo. Alguns países ainda apresentam casos esporádicos, enquanto outros já convivem com circulação endêmica desses microrganismos em ambientes hospitalares.
Vigilância genômica amplia capacidade de resposta
Especialistas em resistência antimicrobiana vêm destacando que métodos convencionais de vigilância possuem limitações importantes para rastrear a dinâmica de disseminação bacteriana em tempo real. Nesse contexto, o sequenciamento genômico completo tem assumido protagonismo crescente por permitir identificação precisa de linhagens, genes de resistência e rotas de transmissão.
Estudos recentes publicados em plataformas internacionais de vigilância genômica indicam que abordagens de sequenciamento profundo podem monitorar simultaneamente múltiplos patógenos hospitalares, acelerando a detecção de surtos e fortalecendo estratégias de controle epidemiológico.
Para laboratórios clínicos e centros de referência, a tendência aponta para integração progressiva entre microbiologia diagnóstica, bioinformática e vigilância molecular. A expansão da capacidade de sequenciamento nos sistemas nacionais europeus já permitiu redução no tempo de reporte e maior padronização das análises.
Resistência antimicrobiana segue como prioridade global
A Organização Mundial da Saúde classifica enterobactérias resistentes a carbapenêmicos entre os patógenos prioritários críticos para desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas e diagnósticas. A combinação entre elevada capacidade de disseminação, limitação terapêutica e potencial de transmissão hospitalar mantém essas bactérias no centro das preocupações globais em saúde pública.
Os resultados do programa europeu reforçam a necessidade de investimentos contínuos em vigilância genômica, prevenção de infecções relacionadas à assistência à saúde, programas de stewardship antimicrobiano e fortalecimento da infraestrutura laboratorial.
A próxima etapa do projeto europeu, denominada CRE25, já está em andamento e deverá utilizar protocolos simplificados de amostragem e fluxos mais rápidos de análise genômica, ampliando a capacidade de resposta frente à evolução da resistência bacteriana no ambiente hospitalar europeu.
